Precalienta el horno a 180 °C y prepara el molde con cápsulas para muffins.
En un bowl mezcla la harina, los polvos de hornear, la canela, la nuez moscada y la sal.
En otro bowl bate los huevos junto con el azúcar, el aceite, la leche y la vainilla.
Incorpora la pulpa de zanahoria y manzana a la mezcla líquida.
Agrega poco a poco los ingredientes secos y mezcla suavemente hasta integrar. Evita batir en exceso.
Distribuye la mezcla en los moldes, llenándolos aproximadamente hasta ¾ de su capacidad.
Hornea durante 22 a 25 minutos, o hasta que al insertar un palillo este salga limpio.
Deja reposar unos minutos antes de desmoldar y enfría completamente sobre una rejilla.